在2259年初，约翰·谢里丹船长接替辛克莱成为巴比伦5号空间站的军事长官。他与指挥团队发现圣地亚哥总统之死实为副总统克拉克策划的刺杀阴谋。随着古老而强大的影族从休眠中苏醒，星际冲突不断升级，空间站内部也面临着日益专制的灵能军团带来的压力。一场关乎银河系未来的史诗冒险就此展开。