小行星撞击引发灾难，世界被“忍”毒侵蚀。五百年后，幸存者聚居旧日海底“海陆”。亡国公主雨与身怀“柳生”之血的少年周防，为复活传说中的“机神将”而踏上拯救世界的冒险征途。