《麻醉风暴2》延续前作，聚焦医疗体制的深层矛盾。从约旦战地归来的萧政勋，卷入一场疑点重重的捷运爆炸案。他与旧日搭档杨惟愉联手，在新生代医生与记者的推动下，直面庞大利益网络，展开一场关于医德、正义与体制的艰难抉择。